En general es recomendable usarlo estandar con los plugines que te gusten/necesites para realizar las tareas que sean.
Suele asociarse a x64dbg con Olly, pero no tienen nada que ver. El autor de x64dbg lo hizo parecido a Olly, para que curva de aprendizaje sea más amena, pero son 2 debuggers completamente distintos.
En resumen: te aconsejo usar lo estandar. Ten en cuenta que es un debugger que está en desarrollo y las actualizaciones pueden corregir fallos o agregar nuevas funcionalidades. En la versión custom, deberás esperar hasta que hagan los cambios que la hacen custom, o bien, olvidarte de los updates.
Saludos!
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