Hola!
Para colocarle argumentos a Olly, mientras tienes el programa corriendo, ve a "Debug"-"Arguments" y le colocas los argumentos con los que quieres iniciar el programa.
Olly te dira que necesitas reiniciar el programa para que los cambios surtan efecto y listo...
Si usas File-Open, hay un textbox debajo de todo donde puedes colocar los Argumentos...
Saludos!