¿Qué modelo es el Seagate? Que sea más viejo no quiere decir que sea peor... hay muchas gamas.
Veo que es un ST33000651AS, Seagate Barracuda XT
Los Western Digital Black Edition son bastante rápidos y fiables, pero Seagate también es muy buena marca.
Aquí hay un review del disco duro y sale en los gráficos comparado con un Black Edition de 2TB y la velocidad/rendimiento es muy parecida.
http://www.storagereview.com/seagate_3tb_barracuda_xt_review_st33000651as120MB/s lectura para el Black Edition creo que son valores normales, lo que es mucho es 175MB/s para el Seagate
No hagas mucho caso al UDMA 6 y 5, eso era antes, además los dos discos duros marca lo mismo, lo que importa realmente es que la placa soporte y los discos sean SATA III
Tu placa base por lo que veo es una Asus P8H61, con una sola controladora (Intel® H61(B3) chipset), por lo tanto da igual donde conectes el disco SATA que tendrá el mismo rendimiento. Lo estaba pensando porque algunas placas base tienen dos controladoras sata y según en cuál conectes el disco puedes obtener diferente rendimiento.
¿En qué disco duro está instalado el sistema operativo?