Este bus está estructurado como carriles punto a punto, full-duplex, trabajando en serie. En PCIe 1.1 (el más común en 2007) cada carril transporta 250 MB/s en cada dirección. PCIe 2.0 dobla esta tasa a 500 MB/s y PCIe 3.0 la dobla de nuevo (1 GB/s por carril).
Fuente:
http://es.wikipedia.org/wiki/PCI-ExpressA ver...
Una tarjeta PCIe 3.0 no desarrolla todo su potencial en una ranura PCIe 2.0, digamos que hay "un cuello de botella", aunque no lo notemos pues a una tasa PCIe 2.0 las cosas fluyen muy bien.
Se me corrija en mi error, que estoy arduo por aprender.