Soy un poco n00b con esto y me gustaria saber si hay algun programa para ver
todos los archivos almacenados en una web, que como sabemos podremos navegar en las carpetas con el "/", ej: ejemplo.com/recursos/datos.pdf.
A eso me refiero, si hay algun programa me lo decis y gracias de antemano! 

Sólo en páginas y en carpetas que tengan habilitado el listado de directorios.

Hola
tienes una aplicación para windows de fingerprinting de paginas web,
extrae todos los documentos ofimaticos publicos(accesibles) a traves de los
motores de busqueda google y bing, y analiza sus metadatos.
Te da la posibilidad de descargarte los documentos

se llama FOCA
es una aplicacion de informatica 64:
http://www.informatica64.com/foca.aspx

te pedira un email,puedes usar esta web de emails desechables(informate de como funciona):
http://mailcatch.com/en/disposable-email