Reliza la convinación Ctrl+Alt+F1 Te loggeas. Estarás en una terminal, una vez alli haces lo siguiente:

Estando seguro de estar en tu home directory:

sudo rm -rf .config .gnome .gnome2 .gnome2_private .compiz .icons .fonts .nautilus .themes .qt .local

Esto borrará los archivos de configuración de gnome y compiz. Puedes usar también estos comandos para reestablecer las configuraciones por defecto:

Para gnome:

gconftool-2 --recursive-unset /

Solo para compiz:

gconftool-2 --recursive-unset /apps/compiz

Saludos