Prueba hacer lo siguiente:
Para instalar Eclipse y Java en Ubuntu ejecutamos el siguiente comando en la terminal:
sudo apt-get install eclipse sun-java6-jdk
Esto descargará de Internet los paquetes requeridos y los instalará en tu computadora, pero Eclipse se ejecutara muy lento, esto es debido a que estará haciendo uso de la versión GNU de Java en lugar de la oficial de Sun, para corregir esto introducimos el comando:
sudo update-java-alternatives -s java-6-sun
Ahora, editamos el archivo de configuración
JVM (Java Virtual Machine)
Y agregamos la siguiente línea al principio del archivo:
Existe un bug (fallo) en Eclipse que ignora la configuración
java-common de Ubuntu (bug 45347); para evitarlo tenemos que editar el archivo
java_home de Eclipse:
sudo -b gedit /etc/eclipse/java_home
Y agregar al principio del archivo la línea:
Fuente:
UbuntuGeekYo también he tenido problemas con Java y Eclipse en Ubuntu y lo he arreglado haciendo eso.