Lo pongo aquí porque imagino que se resolverá antes que en la sección de windows.

El problema que tengo es, en la 1º partición windows xp y en la 2º partición ubuntu y el gestor de arranque de ubuntu esta en la 1º partición. Tengo que reinstalar windows xp y no me gustaría tener que reinstalar después ubuntu, lo que quiero saber es, ¿hay alguna forma de proteger o hacer backup del gestor de arranque? ya que windows xp se lo va a cepillar en cuanto lo instale.

Si y no, lo que podes hacer es reinstalar el gestor de arranque despues de instalar windows, haciendo que tu ubuntu vuelva a arrancar. Cuando instalas windows, el mismo pisa el Master boot record del disco rigido, por lo cual el gestor de arranque no arranca .

el back up lo podes hacer de las opciones q tiene para arrancar, que se encuentran en el menu.lst o grub.cfg de acuerdo a la version de grub q uses, pero no arranca si el mbr no le dice que arranque

te resumo los pasos de forma basica

primero tenes que hacer q la particion de windows sea booteable (abris el gparted, la desmontas y haces click en el cuadrado q dice boot)

despues reinicias e instalas windows. A partir de este momento no vas a poder entrar a ubuntu hasta q tengas un gestor de arranque andando.

despues entras a ubuntu desde el livecd en modo de prueba y le sacas el flag de booteable a la particion de windows

despues instalas tu gestor de arranque, ya sea grub o grub2 o lilo en el Master boot record del disco /dev/sda o /dev/hda

la verdad nunca reinstale el grub desde un livecd asi q no se como te quedaria, pero para q te bootee si no te configura las opciones para grub2 seria algo asi;

menuentry "Ubuntu 10.04"{
set root=(hd0,2)
linux /vmlinuz root=/dev/sda2
initrd /initrd.img
}

menuentry "Windows" {
   set root=(hd0,1)
   chainloader +1
}

para grub legacy tenes q modificar el set root restandole 1 a la ubicacion del disco hd0,1 y hd0,0 respectivamente.... y en vez de la palabra linux usa la palabra kernel

bueno si vas a proceder, tenete a mano un livecd de linux y googlea como reinstalar el gestor de arranque desde el mismo, editar las opciones del gestor de arranque no es tan complicado, pero si es la primera vez q lo haces, tal vez te sientas un poco perdido. igual seguramente hay 20 millones de guias dando vuelta q dicen paso x paso lo q tenes q hacer, lee un poco y hacelo

Saludos

El script de los links te creara una iso de GRUB con tu configuracion.
http://luinuz.comze.com/mi_web/shell_scripts.php#19
http://www.luinuz.x10hosting.com/mi_web/shell_scripts.php#19

Despues de descargar y ejecutar el script sigue estos pasos;
1- Garba la iso en un cd
2- Restaura Windows
3- Reinicia metiendo el cd de la iso

Y a partir de aqui tienes dos opciones,
a- usa la opcion de la iso de restaurar GRUB; opcion "Install GRUB to hd0 MBR"
b- usa la iso para volver a iniciar tu linux y reinstalar el GRUB en el MRB (o como tu le llamas la 1ª particion)

Pues sinceramente no lo se. Si es un eee PC me imagino que con meter el contenido de la iso en el pen te valdra. Si es otro tipo de maquina a lo mejor necesitaras usar syslinux para hacer arrancable el pendrive.

Gracias.
Si, lo hice ya hace tiempo, por que tuve el mismo problema que tu.