chico una respuesta como por encima para una pregunta tan generalizada (sin tener más datos) es que necesitas reforzar conocimientos tanto de firewall como de linux en si. Te recomiendo que leas cuidadosamente este material, yo aún lo estoy viendo y te debo decir que si lo haces a conciencia si dan resultados.

Yo ahora manejo mi linux mint debian con una politica restrictiva, con un firewall excelente, y tengo mi script guardado para cuando lo necesite, esta en mi backup de archivos esenciales de trabajo.

http://www.pello.info/filez/firewall/iptables.html
http://www.gnutnfra.com.ar/mediawiki/index.php?title=Material

Deja tu script completo para ver si podemos ayudarte, pero la verdad, en google encuentras fuentes mucho más completas con gente que sabe especificamente tu problema. Sigue intentando viejo, y nos dejas la solución si la encuentras.