Mira si tienes bien el sources.list...
Pero deberías dar más detalles...
Está en /etc/apt, el mío es así:
#
# deb cdrom:[Debian GNU/Linux 2018.1 _Kali-rolling_ - Official Snapshot amd64 LIVE/INSTALL Binary 20180126-21:23]/ kali-last-snapshot contrib main non-free
#deb cdrom:[Debian GNU/Linux 2018.1 _Kali-rolling_ - Official Snapshot amd64 LIVE/INSTALL Binary 20180126-21:23]/ kali-last-snapshot contrib main non-free
deb
http://http.kali.org/kali kali-rolling main contrib non-free