Normalmente, el primer número indica una diferencia grande entre versiones (hay un avance importante entre la versión 1 y la 2, incluso una reescritura completa). Los otros números indican correcciones y añadidos ( por ejemplo la versión 1.2 puede indicar que se le ha añadido a mayores la funcionalidad X al programa y se han corregido varios problemas, pero el programa sigue siendo básicamente igual que la versión 1.1)
Si llamases a las versiones la 1, la 2, la 3, no sería tan fácil saber cuando estamos ante una gran actualización y cuando ante una corrección menor.