En mi opinión, lo mejor que puedes hacer es estructurar los directorios de la forma más lógica y conveniente para tí mismo, sin necesidad de aplicaciones adicionales.

La cosa es intentar evitar las carpetas de tipo "montón de cosas" que tengan todo mezclado.

Si son muchos archivos, prueba a crear una nueva subcategoría, ya sea por temática, contenido o simplemente fechas.

Una vez pilles la costumbre bien, sabrás encontrar absolutamente todo lo que tengas almacenado en tu máquina de forma eficiente, rápida y sin buscadores.

No se, si esto que te voy a comentar acerca de como tengo organizadas mis carpetas te puede servir de ayuda, pero, yo, por mi parte, tengo clasificadas las cosas por categorias, con titulos mas o menos "descriptivos" en el sentido de que tengo en esa carpeta, y, si es necesario, poner subcategorias; por ejemplo, tengo una carpeta de musica, y, en esta carpeta, tengo otras carpetas de donde es la musica, como, por ejemplo, musica de juegos de consola, canciones de que anime es la musica de esa carpeta, o bien de que pelicula (por citar algunos ejemplos), y, luego, en otra carpeta aparte de la de musica, tengo otra carpeta donde estan las peliculas y las series que tengo, con dos carpetas separadas (una para peliculas y otra para series), y dentro de la carpeta de las peliculas, por tipo (como pueden ser, de terror, animacion y humor, entre otros ejemplos), mientras que en la carpeta de series, las tengo clasificadas por nombre, como pueden ser, no se, stargate, doce reinos, codigo lyoko, elfen lied, o bien street fighter victory, entre otras cosas, y, por otra parte, otra carpeta separada para los diferentes juegos que tengo, con otra subcarpeta destinada para guardar cada juego, y dicha subcarpeta tiene el nombre del juego que contiene (entre otros muchos ejemplos de carpetas que tengo en mi disco duro de un Terabyte externo -931 Gigabyte reales-) aunque ya te lo ha comentado Saberuneko acerca de estructurar los directorios de la forma mas logica y conveniente para ti mismo.
Espero haberte podido ser de ayuda con respecto al tema que comentas acerca de organizar los diferentes directorios.
Saludos.

Gracias crazykenny yo también lo tengo en carpetas, pero tiendo a descargar muchos gigas y luego se van acumulando cosas que con los años me toca ir borrando, igual soy un poco "tiquismiquis"

Randomize puedes aclarar eso un poco? No sé si te refieres a nombrar las carpetas con fechas o realizar busquedas con fecha

Puf, no sé cómo te las arreglas, eso es más o menos lo que hace mi madre, y nunca encuentra nada, luego me pone a buscar a mí los archivos, y me encuentro con 500 y pico "documento-numerosnumeros.doc"...

¿Cómo lo haces? x3