Yo creo que el tuto de Zend está muy bien.

Por aquí puedes empezar:

http://framework.zend.com/manual/2.3/en/user-guide/overview.html

Vale creo que empiezo a entenderlo, es decir se basa en la separación por un lado de los datos ( por ejemplo una clase persona que contenga sus características principales por ejemplo nombre, ap1,ap2,sexo, email junto con el constructor y los setter y getter necesarios de estas características no ?), luego otra supongo que estará separada en otra capa por ejemplo para la conexión de la bd en que contenga la cadena de conexión no?, aparte de las clase persona ( que debería acceder port ejemplo a los datos de la clase persona de la capa datos por ejemplo para añadirlos a la bd, y por último otra capa de diseño donde se llame a las 2 capas antes mencionadas para por un lado recoger el dato en la capa datos de persona y por otro para llamar al insertar por ejemplo de la capa db que se encargara a su vez de hacer la query y meter el dato que contenga el getter no ?.
Así a bote pronto es lo que eh entendido hasta ahora, corregidme si me he equivocado. O si es posible separar aún en más capas un proyecto.