Ejemplo practico :
En las siguientes subcarpetas quiero comprobar que exista el archivo "file.txt" y asi copiarlo a la ruta C:\
pero se nos presenta un problema, que los archivos que si encuentre serán copiados con el nombre "c:\file.txt"
por lo que podrían ser reescritos, asi que nos ayudaremos de la variable RANDOM, para generar un numero aleatorio.

@echo off
:: Nos cambiamos a la ruta donde trabajaremos con los archivos.
cd /d "%homedrive%\archivos"
for /d /r %%_ in (*) do (
if exist "%%_\file.txt" (
call :copia "%%_\file.txt"
)
)
goto:eof
:copia
copy /y %1 "%homedrive%\file-%random:~0,2%.txt"
goto:eof

Si algunos archivos son encontrados te debe de dar en pantalla algo como :
        Ahora, checamos que los archivos hayan sido copiados :

Saludos.

De nada.