Bueno, varias cosas a comentar:
1r. He realizado un análisis con el Rescuedisk Kaspersky 2010 de Bulld0z3r pero no ha encontrado ninguna amenaza después de 2 horas.
2n. Desde la consola de recuperación del disco de Windows 7 he ejecutado un chkdsk /r /p pero sin ningún resultado.
3r. Ahora se está realizando un sfc /scannow para ver si hay algun fichero que se deba reemplazar. Mañana ya os diré qué tal ha ido.
Mientras tanto, si hay alguna alma caritativa se le ocurre alguna opción o solución...
Saludos!