Buenas.

En el foro no se hacen pedidos ni regalos por encargo envueltos con lazito. Si sabes programación entonces puedes formular una duda en el subforo apropiado especificando el lenguaje en cuestión y mostrando tus progresos (para demostrar que lo has intentado hacer por ti mismo), de lo contrario este tipo de solicitudes simplemente no están permitidas, a menos que solicites la contratación de los servicios de un programador, lo cual puedes pedirlo publicamente pero sin mencionar ningún tipo de información personal/e-mail/teléfono, debe llevarse a cabo por mensaje privado.

Si por lo contrario lo único que estás solicitando es la recomendación de algún software de terceros ya sea gratuito o comercial capaz de leer y opcionálmente volcar de forma automatizada el contenido del tal formato pdb, pues como mínimo deberías proveer la información básica y necesaria para darnos a conocer que tipo de formato es, puesto que aparte de que probablemente seas consciente de que el uso de un software para el análisis de semen porcino es muy inusual, tanto que probablemente seas el único usuario en toda la comunidad que esté usando dicho programa, aparte de eso existe casi una docena de formatos privativos conocidos de bases de datos PDB y cada uno de ellos tienen especificaciones distintas, esto impide que cierto tipo de archivos PDB puedan ser reconocidos por ciertos programas que están desarrollados para leer bases de datos PDB.

Vamos, que con la actual ausencia de información en tu solicitud, me cuesta comprender que tipo de respuesta o ayuda esperas conseguir aquí o en cualquier otro lado...

Si quierees probar cosas aleatorias, este programa sirve para leer bases de datos PDB que usen las especificaciones generadas por Microsoft Visual Studio:

• https://github.com/moyix/pdbparse

...pero probablemente no sea lo que necsites puesto que ese tipo de bases de datos contienen información de depuración del programa.

Como ya digo esto es sugerir por sugerir y dando palos de ciego, puesto que no se sabe si tu archivo PDB se trata de un archivo de tipo Protein Data Bank, o un Pluggable Database de Oracle, u otro tipo de base de datos PDB que necesite un programa distinto para poder ser reconocido y leido...

Saludos.