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Prácticamente todos los programas que encontrarás incluido UnLocker forzaran el cierre del programa que bloquea el archivo. Dependerá mucho del programa y como trabaje con el archivo que quieres eliminar o modificar, en el peor de los casos te de un pantallazo azul o se cuelgue Windows por hacer referencia a un recurso o memoria inválido. Si el programa es tolerante a estos eventos si que podrías intentar sobre-escribir el archivo en memoria pero con herramientas nativas del propio Windows no creo que se pueda

Gracias por vuestras aportaciones sobre el riesgo de dañar el archivo o cuelque del sistema. Os comente el programa en cuestion esta continuamente trabajando y por esto mantiene eo archivo abierto para poder escribir en el sin estar abre y cierra, no obstante no esta escribiendo siempre y yo puedo saber en que momento va a escribir y cuando no. El archivo no me importa dañarlo porque antes de forzar cierre puedo hacer una copia sin problemas. Yo lo que si necesito, para evitar cerrar y volver a encender el programa que lo mantiene en uso, por la demora que esto supone, es eliminar el archivo mientras lo tiene abierto, aunque como digo no lleste escribiendo en el.
Si teneis alguna idea de como forzar la eliminacion del archivo.mientras sigue abierto o incluso de modificar algun dato pero siempre sin cerrar la aplicacion que lo mantiene abierto. Gracias.

Hola Serapis y gracias por tu opinion, el programa que mantiene abierto el archivo como comentas no es que tarde 10' en abrirse pero la exigencia de cerrarlo para  procesar los datos del txt complica el trabajo a las personas que deben utiizarlo, esto en el mejor de lo casos. Qienes tienen la posibilidad de evitar esto no estan por la labor de solucionarlo, basicamente porque no tienen que lidear con los inconvenientes que causa y nunca se pusieron en la piel de aquellos a los que piden que realicen la tarea de procesar los datos contenidos en el archivo. Perdona que no te sea mas claro hablando y te explique con detalles todo el proceso y el trabajo que se exige.
Por mi parte he ofrecido soluciones validas y funcionales que ayudarian a procesar estos datos sin ocasionar los inconvenientes que les causa a las personas que deben procesar los datos, pero claro, yo soy una de estas personas y por lo tanto al desarrollar las rutinas encargadas de procesar los datos lo hice pensando tanto en los que tienen que recibir los datos procesados como en los que deben procesarlo facilitando el trabajo de ambos. El problema esta en la sistematica indiferencia de algunas personas por escuchar y ayudar y facilitar el trabajo que exigen que se realice.

En fin, perdona por la charla pero creo que merece la pena señalar que con mi intencion de forzar la eliminacion de un archivo que esta siendo utilizado no hay ninguna actividad virica ni maliciosa, simplemente busco sortear los obstaculos que dificultan el trabajo de algunas personas. Un saludo.

Hay dias que te levantas y parece que el sol sale solo para ti!!! 

Despues de mucho tiempo buscando una solucion parece que me encontre con una utilidad que desbloquea los archivos abiertos. Esta semana intentare ponerla en practica y a ver si por fin lo consigo, por el momento las primeras pruebas parecen muy prometedoras.

Si alguien esta interesado el nombre de la aplicacion es handle.exe y se puede descargar gratuitamente desde los servidores de microsoft. Os dejo el enlace de la pagina.

https://docs.microsoft.com/es-es/sysinternals/downloads/handle