Intentando hacer algo de esto:
# Introducir un valor entero.
a = int(raw_input('Introduce un número: '))
if condición 1:
X1 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es el cuadrado exacto del primero.'
if condición 2:
X2 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es menor que el cuadrado del primero.'
if condición 3:
X3 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es mayor que el cuadrado del primero.'
Sigo intentando y pescando a la vez...
from math import sqrt
# Introducir un valor entero.
a = int(raw_input('Introduce un número: '))
if a == 1:
X1 = sqrt(16)
print 'El segundo es el cuadrado exacto del primero.'
if a < 1:
X2 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es menor que el cuadrado del primero.'
if a > 1:
X3 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es mayor que el cuadrado del primero.'
No se que hay que hacer exactamente. Si hay que usar un if else a lo mejor es buena idea que solo if para arriba y para abajo.
Edito:Una vez más lo intento, parece que se resiste. Me di cuenta que hay que introducir dos números enteros. Lo leí bien el principio.
Eso si, todavía sigo sin entender ni papa de lo que realmente hay que hacer, por eso estoy así.
from math import sqrt
# Introducir un valor entero.
a = int(raw_input('Introduce un número entero: '))
b = int(raw_input('Introduce otro número entero: '))
if a == b:
X1 = sqrt(16)
print 'El segundo es el cuadrado exacto del primero.'
if a < b:
X2 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es menor que el cuadrado del primero.'
if a > b:
X3 = sqrt(16)**2
print 'El segundo es mayor que el cuadrado del primero.'
from math import sqrt
# Introducir un valor entero.
a = int(raw_input('Introduce un número entero: '))
b = int(raw_input('Introduce otro número entero: '))
if a == b:
X1 = sqrt(b)
print 'El segundo es el cuadrado exacto del primero.'
if a < b:
X2 = sqrt(b)
print 'El segundo es menor que el cuadrado del primero.'
if a > b:
X3 = sqrt(b)
print 'El segundo es mayor que el cuadrado del primero.'
Saludo.