class Punto3D(object):
    def __init__(self, x, y, z):
        self.x=x
        self.y=y
        self.z=z
 
    def __repr__():
        return "%d, %d, %d" % self.x, self.y, self.z
 
miPunto=Punto3D(1,2,3)
print miPunto

class Punto3D(object):
    def __init__(self, x, y, z):
        self.x=x
        self.y=y
        self.z=z
 
    def __repr__(self):
        return "%d, %d, %d" % (self.x, self.y, self.z)
 
miPunto=Punto3D(1,2,3)
print miPunto

1, 2, 3
None

No mostraste el punto 3D con el formato correcto

Cuando definas un nuevo __repr__(), retorná un valor de cadena que use las variables miembro de la clase para ver adecuadamente el punto 3D. Podés usar la función str() para ubicar estos números en la cadena apropiada.