¿Te refieres a generar un MD5?, ¿o te refieres a descifrar un MD5?
De todas formas séa cual séa olvídate de criptología y ese tipo de cosas usando Batch
Puedes usar la utilidad commandline externa "md5.exe" para generar el hash desde la consola, obviamente si usases ruby o python o... no necesitarías utilidades externas.
ahora, si hablamos de desencriptarlo, infórmate sobre las carecterísticas de un hash MD5 y lo imposible que es (aunque no imposible del todo según dicen algunos crackers , pero yo hasta día de hoy solo he visto ejemplos online (y de pago) :-/...).
Saludos!