HummmmmEn python, si estás en modo interactivo debe haber alguna opción o atajo de teclado que permita limpiar la terminal, pero...no sé y ni recuerdo si lo hay, sin embargo independientemente,
import os
os.system('cls')
borraría todo lo que se haya escrito en la consola, básicamente ejecutarías el comando
cls del sistema que, limpia la terminal.