Hola,
La fuente por defecto no puedes ponerla en negrita (fuente: mapa de bits), así que debes cambiar a otra fuente, y ponerla en negrita.
Un ejemplo:
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_CURRENT_USER\Console\%SystemRoot%_system32_cmd.exe]
; Fuente lucida console
"FaceName"="Lucida Console"
; Negrita
"FontWeight"=dword:000002bc
Y obviamente los cambios no surgen efecto hasta que vuelvas a abrir otra instancia de la CMD.
EDITO:
PD: ->
REG 2 BAT (By Elektro H@cker)(Para convetir el archivo de registro a "comandos" para Batch)
Saludos.