Esas dos líneas de Batch son complétamente innecesarias, más que nada porque el propio Youtube-dl es capaz de descargar los videos y convertirlos al vuelo usando FFMPEG + FFPROBE, todo en un unico comando...
- Youtube-dl.exe --no-continue --extract-audio --audio-format mp3 --audio-quality 2 -t "http://www.youtube.com/watch?v=1kz6hNDlEEg" 
Espero que hayas aprendido algo nuevo: 
Revisar las opciones de las aplicaciones antes de investigar.
De todas formas te he codeado un bonito script para tener más control sobre el FFMPEG.
PD: El progreso se muestra en la barra de título.

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- :: By Elektro H@cker 
-   
- :: Parámetros 
- Set-  "Youtube_IDS=PoTEnaAI9Fo RvnkAtWcKYg 1kz6hNDlEEg" 
 
- Set-  "Target_Dir=C:\Videos" 
 
-   
-   
- :Download 
- :: Obtengo el título del video. 
- FOR-  /F "Tokens=*"  %%- #  in (- 'Youtube-dl.exe --get-title "http://www.youtube.com/watch?v= %~1- "' ) Do (
 
- 	Set-  " Title- = %%- #"                &-  REM Obtengo el título original 
 
- ) 
-   
- :: Descargo el video a un archivo temporal. 
- Del-  /Q " %TEMP%- \temp.flv" 2 >NUL      &-  REM Elimino el resto  del-  archivo de una sesión anterior. 
 
- Echo-  [-] [Descargando]  :  "%Title%"  &-  REM Muestro información. 
 
- Youtube-dl.exe --console-title --no-continue -q -o "%TEMP%\temp.flv" "http://www.youtube.com/watch?v=%~1" & REM Descargo el video de forma silenciona, el progreso se muestra en la barra de título. 
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- :: Convierto el audio y lo muevo a la carpeta de destino.. 
- MKDIR-  " %Target_Dir%- " 2 >NUL          &-  REM Creo la carpeta si no existiese. 
 
- Echo-  [-] [Convirtiendo] :  "%Title%" &-  REM Muestro información. 
 
- FFMPEG.exe -i " %TEMP%- \temp.flv" -c  copy-  -map_metadata -1 -vn -acodec libmp3lame -ab  %Target_Bitrate%- k " %Target_Dir%- \ %Title%- .mp3"  >NUL-  2 >&- 1  &-  REM Convierto sólamente el audio, sin metadata en el archivo. 
-   
- Echo-  [+] [Convertido]   :  "%Title%" |-  MORE  &-  REM Muestro información. 
 
Saludos