Para filtrar el tráfico p2p puedes hacer uso de ipp2p. Con l7-filter puedes identificar paquetes de la capa de aplicación como Bittorrent, eDonkey, eMule, Kazaa, etc.

Si los usuarios usarán túneles SSL para cifrar la información, ninguno de estos programas te servirá, dado que los paquetes estarán codificados.


Enlaces relacionados:
_Filtering P2P network traffic with ipp2p.

Para el tema de regular el anho de banda:
_Implantación de QoS en un entorno GNU/Linux.
_Traffic shaping y QoS en GNU/Linux.
_Introducción a Control del trafico y a Calidad de servicio en GNU/Linux.
_Enrutamiento avanzado y control de tráfico en Linux.
_MasterShaper.