Para eso existe el Hashing, entre otras cosas...

El hash calculado a un fichero, sirve para identificar si fue modificado el contenido.

Cuando dos contenidos distintos arrojan el mismo, hash se dice que se ha producido una colisión...
Las colisiones vienen a ser inevitables, es decir no se puede predecir (si el algoritmo está bien programado).

Sin embargo cuando se requiera mayor nivel de seguridad, es ideal sacar 2 hashes al fichero, esto es con dos algoritmos distintos. Las probabilidades entonces de que ambos hashes colisionen es el producto de las probabilidades de colisión de ambos algoritmos. Así icluso alguien se las apañara, para alterar el contenido de un fichero y con el mismo tamaño lograr que tuviera el mismo hash que antes... al haber dos algoritmos calculando 2 hashes distintos, los mismos cambios que fueren válidos para 'falsear' el hash para el algortimoA, va ser prácticamente imposible que también sena válidos para el hash calculado por el algoritmoB.

Respecto de tu última pregunta:
No. No hay forma se saber en el mundo digital si un fichero es una copia de otro... entendiendo por copia el mismo contenido.
Cuando se hace una copia de una obra de arte (por ejemplo), siendo algo físico, cabe la dificultad del material, si es antiguo, si usa los mismos materiales, etc... siempre habrá distinciones (otra cosa es que sean fácilmente detectables).

Pero en el mundo digital... supongamos que 1 millón de personas tenemos el mismo S.O. y misma versión y contiene un fichero llamado System.dll, es de suponer que todos tiene el msimo contenidos (salvo que se hayan compilado exprofeso para el procesador destino de cada equipo y que vamos a suponer que no fuera el caso)... Cuál es copia de cuál?. Tu fichero del mío o el mío del tuyo. Si son idénticos, que más dá.
Cuando tienes un fichero en el disco duro de tu pc, y lo copias a una memoria USB... es una copia, jamás será el del PC. No es físico, aunque la unidad de almacenamiento si lo sea. En realidad tu pregunta es absurda, y es propia de un niño que empieza a utilizar los ordenadores y no sabe gran cosa de tecnología.

Si tienes un fichero y no quieres que nadie tenga copia del mismo, entonces lo que tienes que hacer es cifrarlo con una contraseña. ...típicamente, los programas compresores permiten al comprimir cifrarlo con una contraseña. Todavía podrán tener copia de éste, pero sin la contraseña, no podrán descomprimirlo y por tanto no podran tener acceso al fichero original.

...pero todo esto es algo que si.. por lo menos utilizas ordenadores desde hace varios años, ya deberías saber.

Técnicamente la fecha no forma parte del fichero.
La fecha y otros atributos son lo que se llaman los metadatos, igual que el nombre del fichero.
Cuando copias un fichero a otra unidad, se copia como mínimo el contenido, suele copiarse el nombre dle fichero y el resto de metadatos, pero solo cuando es posible, por ejemplo, la fecha de último acceso cambia cada vez que abres el fichero, pero las fechas no son fiables, porque se pueden cambiar, lo mismo que un atributo de 'sólo lectura', o el nombre del fichero.

Claro que usar algo, no implica conocer como funciona por dentro, pero es común que cuando alguien se interesa por algo, conozca ciertos detalles mínimos, como también es lo normal que algien que maneja algo 20 años sepa ciertos detalles más allá del mero uso, de aquello que usa. Pero no es obligatorio, ciertamente, aunque siendo éste un foro d eprogramación, se da por supuesto que los usuarios habituales, tengan un conocimiento 'muy por encima de la media'...

Si usas un programa para guardar los datos que precisas, claramente puede no tener posibilidad de hacer ciertas cosas, ahora bien, entiendo que si se trata de una partida de un juego, deberían esmerarse en no guardar los datos en texto plano, si  existe la posibilidad de que sena maniplados por el jugador o peor por otros jugadores...

Pero francamente, si usas un programa que tiene sus usos y limitaciones, para qué te preocupas por el asunto?. Es como preocuparse por que un vehículo no puede avanzar sobre zanjas de 6 metros de largo... claro, 20, 30 centímetros ya sería un reto quizás un 4x4 tenga mas capacidad pero llegado un punto es pedirle peras al manzano.

Quizás lo más acertado sea escribir al programador y pedirle lo que quieres, aclarando el porqué de dicha necesidad, si ciertamente el fichero sea accesible y manipulable, no costaría mucho convencerlo para que hiciera cambios en la siguiente versión del programa.

Hola!!! Para eso puedes generar un hash para verificar la autenticidad:
 

Hash se refiere a una función o método para generar claves o llaves que representen de manera casi unívoca a un documento, registro, archivo, etc., resumir o identificar un dato a través de la probabilidad, utilizando una función hash o algoritmo hash.

@Falo Zipo Pixote: Tranquilo amigo.

El usuario @scully ha dado su opinión; y si bien ya había sido mencionada, se valora el esfuerzo de comentar algo sobre el tema.

Además, ten en cuenta de que es un usuario nuevo y puede tomarle tiempo adaptarse al foro (aunque venga leyéndolo hace tiempo).

Cualquier consulta, me mandas un MP (para no desvirtuar más el hilo).

Saludos!