Sigo votando por un Thread..

De pasada puede ser asi:

#include <stdio.h>
#include <windows.h>
int main()
{
	int i = 0;
	while (i<1)
	{
		if(GetAsyncKeyState(13)) i++;
		printf("\n Bucle 1 %i", i);
		Sleep(100);
	}
	while (i<2)
	{
		if(GetAsyncKeyState(13)) i++;
		printf("\n Bucle 2 %i", i);
		Sleep(100);
	}
	while (i<3)
	{
		if(GetAsyncKeyState(13)) i++;
		printf("\n Bucle 3 %i", i);
		Sleep(100);
	}
	MessageBox(0, L"Terminado", L"Terminado",MB_OK | MB_ICONSTOP);
	return 0;
}

A no ser que necesites que los 3 se inicien al mismo tiempo.
Si te decides que sea multiplataforma te recomiendo Qt4

protected:
void keyPressEvent(QKeyEvent * event);

En los proyectos con GUI funciona muy bien.

Hola! En mi opinión no vale la pena que te pongas con threads. He leido el post y esto te podría valer,supongo qe ya tienes el main... jeje, mira:

int control=1;
while(control)
{
     //source code
    if(kbhit()) //si detectamos evento de tecldo
   {
       control=0;
      setbuf( stdin, NULL ); //vaciamos el buffer
   }
}

kbhit no esta implementada en GNU/linux, tengo por aqui el codigo de la implementación de la funcion para linux por si te interesa.