Gracias a todos por responder [maldillo -- Chuidiang -- sapito169],
Bueno, todas las ayudas me sirvieron para aclarar un poco las ideas, y la verdad necesitaba los botones superpuestos para decorar la interfaz grafica de a aplicacion, y pues no logre superponer mis botones en tiempo de ejecucion, asi que pense en otra solucion un poco menos practica, pero que obtiene los mismos resultados que queria como se viera....
La solucion fue realizar mi matriz con labels transparentes y con un borde negro, de esta forma cuando creo los botones nunca se me van a ocultar debajo de la matriz ya que esta es transparente... Tambien le agregue un fondo gris a mi frame y ps da la impresion que la matriz fuese de color gris - negro....
Y el efecto del frame blanco es una imagen que ajuste a la ventana.... y ya con eso quedo conforme, en apariencia eso era lo que buscaba....
Doy la solución que encontre por si alguien le sucede lo mismo....
Nuevamente gracias a todos..!!!