Yo esque lo que haria directamente seria:

         parser analizador;
         analizador = new parser(new Scan(new java.io.FileInputStream(argv[0])));     
         analizador.parse();

Y que parsee el fichero que sea argv[0] o incluso
         analizador = new parser(new Scan(new File(argv[0])));     

Si no entiendo mal yo creo que lo resuelves asi...

Contestame si me equivoco.

Saludos