Muchisimas gracias! Pero podrias poner que hace cada cosa? :| Es que no lo acabo de entender  

int num[]={1,2,3,4};<==array con los numeros de la matriz inicial.
............................
for (k=0;k<4;k++){
      p++; <==inicio e incremento el array "num"
        for (i=0;i<4;i++){
            for (j=0;j<4;j++){
               if (v1[i][j]==num[p]) { <==voy cogiendo los distintos numeros de la matriz: el 1,2,3,4
                  b[k][j]=v1[i][j]; <==para cada num lo coloco en la linea correspodiente:los 1 en la primera, los 2 en la segunda ......
                  d[k][j]=v2[i][0]; <==veo las coincidencias con la matriz de control, la de ceros y unos y los meto en otra matriz 
               }
            }
         }
    }
Pero como te comente, corre el programa y veras que te da la matriz
 "b"         "d"
1 1 1 1      0011
2 2 2 2      0010
3 3 3 3      1101
4 4 4 4      1100
 

#include <stdio.h>
 
int main()
{
    int i,j,k,p=-1;
    int num[]={1,2,3,4};
    int v1[4][4]={{1,2,3,4},
                 {4,3,1,3},
                 {2,1,4,2},
                 {3,4,2,1}},
       v2[4][1]={0,
                 1,
                 0,
                 1};
    int b[4][4]={0},d[4][4]={0};
    for (k=0;k<4;k++){
      p++;
        for (i=0;i<4;i++){
            for (j=0;j<4;j++){
               if (v1[i][j]==num[p]) {
                  b[k][j]=v1[i][j];
                  d[k][j]=v2[i][0];
               }
            }
         }
    }
   for (i=0;i<4;i++){
      for (j=0;j<4;j++){
         printf ("%d  ",b[i][j]);
      }puts ("\n");
   }
   puts ("\n");
   for (i=0;i<4;i++){
      for (j=0;j<4;j++){
         printf ("%d  ",d[i][j]);
      }puts ("\n");
   }
    return  0;
}
 

#include <stdio.h>
#include <math.h>
int main()
{
   int v1[3][3]={{1,2,3},
                 {4,5,6},
                 {7,8,9}},
       v2[3][3]={{2,4,8},
                 {6,9,18},
                 {3,4,5}}, i,j,k;
   float d[3][3]={0};
   /******ESTO PARA VER COMO SE RESTAN LAS LINEAS*************/
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){
         for (k=0;k<3;k++){
            d[i][j]+=v2[i][k]-v1[j][k];
         }
      }
   }
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){
         printf ("%g  ",d[i][j]);
      }puts ("\n");
   }
   puts ("\n");
   /*****************CALCULO DE CUADRADO DE DISTANCIAS****ESTO SOLO YA TE VALE****************/
 
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){d[i][j]=0;
         for (k=0;k<3;k++){
            d[i][j]+=pow (v2[i][k]-v1[j][k],2);
         }/* d[i][j]=sqrt (d[i][j]);<== para calcular aqui las distancias y quitando CALCULO DE DISTANCIAS */
      }
   }
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){
         printf ("%g  ",d[i][j]);
      }puts ("\n");
   }
/*****************CALCULO DE DISTANCIAS********************/
 
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){
            d[i][j]=sqrt (d[i][j]);
      }
   }
   for (i=0;i<3;i++){
      for (j=0;j<3;j++){
         printf ("%g  ",d[i][j]);
      }puts ("\n");
   }
   return 0;
}
 

for (i=0; i< Tam; i++) {
        if (array[i]>=80) break;
         cout <<array[i])<<" ";
}

#include <stdio.h>
 
main(){
  int num[5]={0};
  int i=0;
  for(i=0;i<5;i++){
    printf("\nValor %d:",i+1);
    num[i]=i+1;
    printf("Valores: %d", num[i]);
  }
}