No se, lo que se me ocurre ahora a mi sería hacer un archivo de configuración bastante sencillo:
o algo así, donde TableName sería el nombre de la tabla y OrderType sería por qué campo de la tabla ordenar y si ascendente o descendente. Luego lo parsearía con algo para que me quedara dentro de un arreglo asociativo, tipo:

$config = open_config("archivo_configuracion.conf");
 
// Voy a ordenar la tabla contacto.
$sql = 'SELECT * FROM agenda ORDER BY '.$config['contactos']['orderType'];
 
// ejecuto la consulta.
 

Ahí estaría ordenando la salida de la consulta a la tabla contactos por nombre según mi archivo de configuración. Igual, puede ser de cualquier forma que quieras el archivo y la forma de obtener los datos.
Nota la consulta SQL puede estar mal.

Los foros suelen guardar toda esa información en una base de datos. Tienen una tabla para la configuración con distintos campos en tu ejemplo tipo ENUM, si o no, o INTEGER 0 ó 1. Así se suelen manejar los booleanos.

Lo más práctico que puedes hacer desde luego es hacer una base de datos y la confiiguración la guardas en una misma tabla de la base de datos. Creo que es lo mejor.

Claro, tal y como has dicho,tu accedes a la base de datos y compruebas el valor y según ese valor aplicas la etiqueta html que sea.

Si lo haces con un if y elseif no va, pero hazlo con un if debajo de otro, así si que funcionaría, porque lo harías de la siguiente forma:

$texto contiene el texto vale? ahora entras en una serie de if's

if(bold==1){
 $texto="<b>".$texto."</b>";
}

if(under==1){
 $texto="<u>".$texto."</u>";
}

Eso funcionaría perfectamente el resultado sería un texto negrita y subrayado. Por qué?

Pues si hacemos un ejemplo por ejemplo:

$texto="hola que tal";

Entramos a los if's y están ambos activados así que en el bold la cadena $texto contiene:
"<b>hola que tal</b>";

después entra en el siguiente if y está activado también, pues sería:
"<u><b>hola que tal</b></u>";

Resultado?

Hola que tal

Por lo tanto está bien aplicada esa lógica y debería de funcionar bien, pruebalo y ya nos cuentas.

Yo personalmente me haría una función en php a la que se le pase como parámetro el texto y que automáticamente le aplique los estilos correspondientes dependiendo de las opciones marcadas (si subrayado o no, si negrita o no, si italica o no etc) y así simplemente llamas a esa función que aplicará los estilos y dejará el texto formateado sin mayor complicaciones.


Saludos.

Al parecer ya lo tienes resuelto, pero se me ocurren algunas ideas...

Supongamos tu tabla esta asi:

element	bold	under	italic
enfasis	0	0	1
titulo	1	1	0
enfasis2	1	0	0

Y aqui lo interesante, haces una consulta SQL por un elemento que te indica como aplicar los formatos

SELECT bold, UNDER, italic FROM nombre_tabla WHERE element = 'titulo';
 

Despues, obtenemos el resultado en un array asociativo. En el siguiente codigo, ese array se llama $resultado_db.

En la variable $r tienes el texto al que aplicar formato:

$r = "Cadena por aplicar formato";
$formatos = array
(
	'bold' => '<b>*</b>',
	'under' => '<u>*</u>',
	'italic' => '<i>*</i>'
);
foreach($formatos as $atributo => $html)
{
	if($resultado_db[$atributo] == 1)
		$r = str_replace('*', $r, $html);
}
 

En resumen, lo que hace ese codigo es recorrer el array de formatos y si del resultado obtenido de la consulta SQL tiene un "1" en algun campo (que estan en los indices del array formatos) sustituye el "*" del valor del array por el texto original en la variable $r, asignandolo a la misma variable $r para asi aplicar multiples formatos.

Un tip, incluso en vez de poner como esta el "under" en el array de formatos, puedes usar CSS y otros elementos:

'under' => '<span class="subrayado">*</span>'

Es algo que se me ocurrio al momento  espero pueda servir

Edito: Si tu cadena original contiene un "*", entonces puedes escoger un patron que practicamente no vaya a existir para evitar sustituciones donde no van