Hola, no sé si te servirá de algo, pero a mi me ocurría algo parecido al pasar una película a mpg con el TMPGENC, los moderadores del foro me dieron varias soluciones y al final conseguí oírla. Yo tenía el clip de video que se oía pero al transformarla ya no se oía nada, el tema es "subtítulos y sonido" y está en esta misma página.  Ánimo.