Entiendo que quieras insertar los subtitulos con el Sony Vegas por sus múltiples opciones para el subtitulado, pero hay algunas alternativas también más simples que según lo que busques te pueden servir o no.

Supongo que tu problema con el pixelado se debe a la configuración de tu codec para comprimir el vídeo, miralas e intenta ponerlas con los mismos valores que el video original.

En caso de que no sea así, te recomiendo un paseo por Youtube donde hay muchos videotutoriales que explican ese proceso de subtitulado con el Sony Vegas y así podrás seguirlos paso a paso.

Un saludo.