Sabes  a mi me sucedio lo mismo  pero con otro juego con el zelda ocarina  , entraba a un tunel de un arbol y me aparecia el error , no recuerdo  que decia  pero siempre que cuando entraba ahi me aparecia el error . Eso yo creo que se produce por que le faltó algo al mismo juego(rom) como un archivo.
 Lo que hacia para arreglarlo era pasar etapas del juego o avanzar  por otras partes hasta que se solucionaba  solo  algo asi que como que evitaba que cargara esa parte,  si pasaba  por ahi  aparecia el molesto error y si no  seguia normalmente

Esto  no es una respuesta muy satisfactoria que digamos pero si puedes evitar que carga en esa parte hazlo  sino  busca el mismo rom  desde otra pagina y pruebalo   .chao

Post :
Algo  te iba a preguntar sabes en que pagina está el Yoshi Story para descargarlo a click ( descarga directa) te agradeceria  si me pudieras escribir  . chao.