Ah, cómo me gustaría hacer, pero intento cosas más básicas 1ero. Pero toman mucho y no me aguanto, escribo ideas y leo las suyas.

https://www.mobygames.com/game/platform:nes/sort:date/page:1/

Donkey Kong + Donkey Kong Junior:
Boswer ha capturado a Pauline y a Kong y los va llevando a lo alto de una torre. Resulta que él estaba manipulando a Kong para que capture a Pauline. Mario y Kong Jr unen fuerzas para rescatar a sus seres queridos, cada uno controlado por un jugador distinto, o pudiendo cambiar cual se controla. Mario sería indispensable para apagar fuegos con su martillo en ciertas zonas, y Donkey para dejar caer frutas en enemigos que de otro modo no dejarían pasar a Mario. También podría ser que cada uno pueda activar cosas que permitan al otro pasar, particularmente Kong porque puede agarrarse de lianas.
No se me ocurre más xP

Popeye + Mario Bros:
Los villanos forman una alianza, lo que no me queda claro es cómo podría ser el juego porque los tipos de juego son bastante distintos, uno de pantallas fijas y el otro no. Quizá algunos rounds de pantallas fijas y otros no. Popeye no puede saltar, y en lo posible no me gusta modificar cosas de los personajes así que así se queda. Mario activaría puentes tras cruzar precipicios y escaleras tras pasar por encima de los tubos. Popeye no puede aportar mucho, podría ser que su puñetazo sirva para romper ladrillos o golpear cubos que estén en tierra y que Mario no podría golpear. También podría vencer enemigos en sitios estrechos donde Mario no podría saltar. Sus disparos no hieren a los armadillos pero los puñetazos de Popeye podrían dejarlos KO y luego se podrían patear. Brutus sería problemático para Mario porque con su salto contratacaría los pisotones de Mario y le impediría pasar poe encima de Boswer.

Baseball + Tennis:
Puaf. Podría ser que en vez de lanzarse con la mano se lance la bola con una raqueta y cada jugador que debe atrapar la bola tuviera una raqueta también que podría usar para hacer los pases más rápido. Si se quiere, el bateador también podría tener una, pero dejaría de ser bateador y probablemente se facilitaría demasiado hacer Home runs. Tal vez habría que sustituirlo porque la bola toque cierto lugar de un muro en lo alto. Una red como techo o algo así podría evitar que tantas bolas se salgan de los estadios. Podría ser que luego de 2 outs se pueda usar una raqueta en vez de bate.
Si se quiere un poco más de tenis, podría ser que la bola deba pasar cierta red y si bota 2 veces los jugadores pueden avanzar de base.
Eso usando una cancha de Base Ball. Usando una de tenis no se me ocurre mucho. Jugar al "tenis" con un bate parece un sin sentido y jugar a que sólo atrapen saques no tiene mucha gracia a la larga.

Pinball + Wild Gunman:
Con la pistola uno podría influir en la trayectoria de la bola, lo que no me doy cuenta es cómo podrían encajar los fugitivos. Tal vez, a veces cuando la bola les pase por al lado se escucharía la señal Fire! y uno en ese momento debería hacer que la bola los golpee, pero antes no o se pierde puntos. O aparecerían de repente en la pantalla, salidos de algún lado.

Duck Hunt + Golf:
Otro puaf. En las pistas habría muchos patos volando. Luego de golpear la bola, el jugador debería rápidamente disparar a los patos para evitar que obstaculicen la trayectoria. No lo hagan real @#! O usen globos.

Hogan's Alley + Donkey Kong 3:
Otro pero estos en serio que pegan poco. No se debe disparar al Kong, es un especimen muy valioso, pero se puede disparar a los bichos. Mientras, por las ventanas y otros sitios en los costados aparecerían los personajes del Hogan's Alley. Sería para 2 jugadores, uno con la pistola y el otro con el tipo que tira veneno, sino ese podría ser manejado por una IA. Que los disparos de la pistola puedan afectar al Kong podría ser, pero no tiene mucha lógica que sólo lo hagan subir. Tal vez si avanzar hacia la pantalla o se viese desde abajo (aunque sería un poco asqueroso).

Nuts & Milk + Lode Runner:
El personaje de LR evidentemente podría crear hoyos para que Milk pueda bajar a sitios donde normalmente no podría, o escapar si es un sitio muy estrecho donde no pueda saltar. Para que Milk sea fácilmente útil debería haber cosas que sólo él pueda activar, llegando saltando. También podría ser que cada uno pueda juntar también lo que necesita el otro, entonces cosas que uno no pueda agarrar las debe agarrar el otro. Pero, quizá, antes de poder finalizar el round, deberían acercarse para que las intercambien. El personaje de LR podría caer encima de Milk y así evitar caer más bajo, además podría ser llevado por él pero no podría moverse/saltar tan alto mientras lo hace.

Galaxian + Devil World:
No recuerdo mucho del 2ndo pero... No, está difícil igual, aunque ambos sean en pantallas fijas. Tal vez, las naves estarían encima de los laberintos, y parte de su objetivo sería proteger al ángel, algunos aliens intentarían chocarse con él.

F1 Race + Pac Man:
Jaja. Bueno, se vería como el F1 pero sería el Pac Man y fantasmitas y en la pista que sería un laberinto habría pelotitas que se deberían comer xP
Esa parte que te transporta al otro lado de la pantalla podría ser una ruta semicircular por encima de la otra.
O podría ser que el Pac Man se pueda subir a un F1 de vez en cuando.

Lo dejo por hoy. También se podrían hacer mezclas de 3, 4, etc, eh.