Hola a todos...
Quiero comenzar a programar en java pero necesito un programa que puede programar webs dinamicas y que sea compatible con linux...soy principieante y agradeceria cualquier ayuda que puedan brindarme...gracias.

Hay muchos IDEs para programar en java, como ha dicho marioly, personalmente te recomiendo eclipse o netbeans, que son los más populares.

De todas formas estaría bien que te aseguraras de qué quieres hacer y cómo, para leer más:
http://java.sun.com/products/jsp/
http://java.sun.com/applets/
http://en.wikipedia.org/wiki/Ajax_(programming)