Bueno,ante todo dar las gracias a los miembros de este foro por ayudarme con algunas dudas que me han surgido a la hora de hacer este programa.  

package RSA;
 
import java.math.BigInteger;
import java.util.Random;
import java.util.ArrayList;
import ClavePublica.ClavePublica;
import ClavePrivada.ClavePrivada;
import Euler.Euler;
 
/**
 * Codificación en RSA
 *
 * Autor: Tronos154
 */
 
public class RSA {
 
    public Random rnd1 = new Random();
    public Random rnd2 = new Random();
    public int bitsLength = (int) Math.random() * 56 + 200;
 
    public BigInteger primo1 = BigInteger.probablePrime(bitsLength, rnd1);
    public BigInteger primo2 = BigInteger.probablePrime(bitsLength, rnd2);
    public BigInteger modulo = primo1.multiply(primo2);
 
    public BigInteger euler = Euler.Euler(primo1, primo2);
 
    public BigInteger clavePublica = ClavePublica.ClavePublica(euler);
    public BigInteger clavePrivada = ClavePrivada.ClavePrivada(clavePublica, euler);
 
    public String cifrar(String texto) {
 
        char letra;
        int letra2 = 0;
        String textoEncriptado = "";
        String letra3 = "";
        int contador = 0;
 
        while (contador < texto.length()) {
            letra = texto.charAt(contador);
            letra2 = letra;
            letra3 = String.valueOf(letra2);
            BigInteger numero = new BigInteger(letra3);
            textoEncriptado = textoEncriptado + (numero.modPow(clavePublica, modulo)).toString() + " ";
            contador++;
        }
        return textoEncriptado;
    }
 
    public String descifrar(String textoEncriptado) {
        String textoDesencriptado = "";
        String textoAlmacen = "";
        char letra = 0;
        for (int i = 0; i < textoEncriptado.length(); i++) {
            if (textoEncriptado.charAt(i) == 32) {
                BigInteger numero = new BigInteger(textoAlmacen);
                letra = (char) (int) (numero.modPow(clavePrivada, modulo).longValue());
                textoDesencriptado = textoDesencriptado + letra;
                textoAlmacen = "";
 
            } else {
                textoAlmacen = textoAlmacen + textoEncriptado.charAt(i);
            }
 
        }
        return textoDesencriptado;
    }
 
 
 
}
 

Librerías que se han creado para el programa:

Clave Publica:

package ClavePublica;
 
import java.math.BigInteger;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Random;
/**
 * Generador Clave Publica
 *
 *
 * Autor : Tronos154 
 *
 */
public class ClavePublica {
 
    public static BigInteger ClavePublica(BigInteger euler) {
 
 
        BigInteger ONE = BigInteger.ONE;
        BigInteger ZERO = BigInteger.ZERO;
        BigInteger Euler2 = euler.subtract(ONE);
        Boolean enc = false;
 
        while (enc == false && Euler2.compareTo(ONE) == 1) {
 
            if ((euler.gcd(Euler2)).toString().equals("1")) {
                enc = true;
 
 
            } else {
                Euler2 = Euler2.subtract(ONE);
            }
        }
 
       return Euler2;
    }
 
}
 

Clave Privada:

package ClavePrivada;
import java.math.BigInteger;
 
/** Clave Privada
 *
 * Autor : Tronos154 
 * 
 */
public class ClavePrivada {
    public static BigInteger ClavePrivada (BigInteger clavePublica , BigInteger euler) {
        BigInteger clavePrivada = clavePublica.modInverse(euler);
        return clavePrivada;
    }
}
 

Función Euler :

package Euler;
 
import java.math.BigInteger;
import java.util.ArrayList;
 
/**
 *
 * Autor : Tronos154  
 */
public class Euler {
 
    public static BigInteger Euler(BigInteger primo1, BigInteger primo2) {
        BigInteger ONE = BigInteger.ONE;
        BigInteger Euler;
        Euler = (primo1.subtract(ONE)).multiply(primo2.subtract(ONE));
        return Euler;
    }
 
}