Tengo un programa en java, que usa un comando de la consola, pero quisiera poder el almacenar el valor que devuelve en una variable para saber que usuario esta usando el programa

Nota: No lo se si funciona asi, no lo e probado, solo modifique otro codigo que hice que ejecuta un Bat, pero queria ver si se podia almacenar el usuario devuelto por la consola

Sí de hecho son la clase System puedes obtener muchos datos de la pc y usuario.

Me parece que de la otra forma que intentabas no es posible.