yo lo pondría asi:
IDE Primary: HDD (Master) + HDD 2 (Slave: storage)
IDE Secondary: DVD-RW (Master) + CD-RW (Slave)
más que nada porque no creo que grabes dos cosas a la vez, y asi tienes un "cable" que irá a buscar la información al hdd y otro cable que llevará la información a la grabadora...
(yo lo tengo asi xDD)
sobre tu otra cuestión...
S-ATA 1: HDD
IDE Primary: DVD-RW (Master)
IDE Secondary: CD-RW (Master)
sería lo mejor, ya que sata es más rápido que ide (y además cada cosa esta en un cable distinto), pero como te he dicho antes no creo que grabes y/o leas dos cosas a la vez, por lo que si pones la grabadora de dvds y la de cds en el mismo cable no pasará nada (bueno puede ser que leas y grabes a la vez, pero pocas veces suele pasar, jejeje...)
salu2