No. Cuando conectas algun disco duro o grabadora a los conectores 5-6 no te detecta nada porque tendras el modo de operacion SATA a IDE (fijate en el manual). Los conectores 5-6 solo soportan los modo RAID y AHCI "only" y no IDE, por eso cuando conectas disco o grabadora no te detecta nada de nada. El modo de operacion SATA lo puedes poner en modos IDE, AHCI o RAID, por defecto te vendra en modo IDE y te funcionan los 4 primeros conectores. Como ya tienes instalado el SO y tal en disco duro principal como IDE (como viene por defecto) mejor que no toques mucho...
Cuando quieras hacer un RAID solo tienes que mirarte el manual del usuario de tu placa base.
http://es.wikipedia.org/wiki/RAIDhttp://en.wikipedia.org/wiki/Advanced_Host_Controller_InterfaceSaludos