No se... es que la caja donde esta tu tarjeta madre también debe ser bien reducida, y allí por lo general no cabe una tarjeta gráfica... ese el problema de comprar este tipo de hardware, que luego no se puede expandir la maquina, ademas de que no se puede tener una buena refrigeración en ellas, y las tarjetas gráficas producen bastante calor...
Por eso pensando a futuro siempre es mejor comprar maquinas de tamaño estándar que se le pueda agregar todo lo que uno necesita como tarjetas gráficas, memoria RAM, sistemas de refrigeración, etc... y tu placa tiene slot PCIe donde colocarle la tarjeta gráfica, pero la caja debe ser pequeña y allí no cabe la tarjeta porque estas bichas no son pequeñas mas que todo por el sistema de refrigeración que traen...
Pero... tu hablas de la placa madre pero no de la caja... es en realidad muy pequeña???... podrías poner el modelo o una foto para ver como va el asunto...
Saludos.