No es que este muy metido en troyanos, ni nada por el estilo, pero para acceder a un ordenador infectado por un troyano, supongo (y solo supongo) que tu o el ordenador "infectado" ha de tener una ip que no varie; cuando estudie el primer año en grado medio de informatica, hicimos una practica con un troyano; concretamente con el netbus si mi memoria no me falla (y de eso hace ya 3 años), y creo recordar que en la parte del troyano que es la que definiriamos como cliente, el que tu usarias en este caso para meterte en el otro ordenador por decirlo asi, has de insertar la ip del programa servidor, si no recuerdo mal, lo que significa que tu te conectas al otro ordenador mediante la parte que definiriamos como cliente del troyano.
A ver, estoy haciendo suposiciones, por decirlo asi, teniendo en cuenta que ese sea el "funcionamiento" correcto de los troyanos, y que todos los programas que se usan para crear troyanos sigan este procedimiento de insertar la ip del servidor; no obstante, si tienes experiencia creando troyanos, u otros programas que requieran de una interaccion a traves de internet para hacer una serie de tareas, como control remoto en el caso de los troyanos, tambien se me ocurre que la parte que hace de servidor se "intente" comunicar con la parte cliente para establecer una conexion y hacer lo que este destinado a hacer, como ahora el control remoto en caso de troyanos, cuando se cumpla una condicion, como ahora que arranque el sistema o el ordenador se conecte a internet (vamos, que el ordenador supuestamente "infectado" por el troyano se conecte a tu ordenador, por decirlo asi). La pega de esto es que si quieres hacerlo asi, por decirlo de alguna manera, te has de asegurar que si hay algun problema con la conexion a tu ordenador (como ahora que no se conecten los dos ordenadores) es que el programa "servidor" (el de la persona infectada) no de ningun error si ocurre algun problema para que la persona no sospeche de que le pueda haber entrado algo, por decirlo asi.
Desde luego, estoy hablando de algo teorico, ya que a mi no me gusta mucho esto de hacer programas que se comuniquen entre si a traves de red y/o internet; lo veo como un tema demasiado "problematico" como para dedicarme yo solo a este tema; de todas formas respeto las opiniones de la gente que le gusta el tema de programacion de cualquier sistema de trabajo en red y no por eso voy a menospreciar su trabajo; es mas, hago todo lo contrario, ya que aparte de ser una tarea algo "problematica" esta de programar aplicaciones en red (para mi por supuesto; el resto de personas no se como lo veran) lo veo como un tema algo complicado; si que es cierto que, por decirlo asi, me hago una ligera idea de como transferir informacion de un ordenador a otro, pero no es que me llame demasiado la atencion esto de programar en red por lo que he dicho.
Espero haberte sido de ayuda.
Saludos.

Exactamente, eso seria una VPN (Podes montar tu VPN vos mismo) o tambien googlea CyberGhost VPN que es muy buena y gratuita, Suerte.