Me gustaría ir viendo que hace el código fuente, es decir cada archivo del código, no en completa profundidad, pero sí tener una ligera idea sobre todos los archivos que lo forman para después poder estudiar partes que me interesen. Sé perfectamente que mis conocimientos no podrán asimilar muchas partes, pero seguro que algunos sí.
Lo que necesito es como una especie de guía sobre el kernel.

Por ejemplo en la carpeta sound del kernel 3.5 me encuentro 20 carpetas, la primera se llama aoa, otra se llama i2c, etc. Seguramente exista alguna guía para entender que hay en cada carpeta o algo así, eso es lo que busco.

Un saludo!  

Ten miedo, ten mucho miedo, tengo entendido que el verdadero codigo que tiene la fundacion poseedera de kernel, es superior a 10 millones de lineas de codigo...

Logico, entender el codigo no es necesariamente dominar linux, son varios modulos independientes, creo que lo que necesitas más es entender su estructura de compilacion, y yo creo que si vas a tomar el riesgo, instala un linux desde cero, a lo vikingo, como un guerrero, es una experiencia muy dura pero muy gratificante.

Para eso, es muy recomendable empezar con arch linux, que al menos tiene una documentacion muy pero muy amplia, ya después, Gentoo/Centoo, Debian (el puro, sin adornos) o Linux From Scratch (LFS es sinceramente para amantes de vi/vim/emacs) es el siguiente reto, con eso, vas a entender muy bien la estructura de linux.

Pero hay que tener cuidados, un paso en falso y jodes todo, es mejor hacerlo en maquina virtual y ser conciente de lo que se hace (osea, teniendo internet a la mano, por eso la maquina virtual, o si lo haces sin nada de eso es que eres kamikaze), es algo muy frustrante, pero muy enriquecedor.

Más que codigo fuente, necesitas es entender como trabaja linux, y como puedes aprender eso? trabajandolo: instalandolo, conociendolo, configurando y rearmando, protegiendo y sanando, puliendolo y refinandolo.

O puedes hacer algo aun mejor, consigue solo kernel, y lo compilas solo, y desde ahi te las arreglas para meterle algo, intenta con BSD, que ese es otro campo. 

Considero más que necesario que aprendas un poco de historia, sobre la tematica del asunto, mira estos links

http://biblioweb.sindominio.net/telematica/catedral.html
http://biblioweb.sindominio.net/telematica/hacker-como.html

muy buenos materiales introductorios para la materia.

Si es el núcleo puro controladores y opciones para el mismo y algunos paquetes muy importantes como puede ser netfilter.

No los paquetes estilo apt-get, entorno gráfico no estan, x11 lo desconozco si viene en el núcleo, todas los paquetes estilo apt-get, cat, ls, las tipicas ordenes de la terminal estan e la base del sistema no en el núcleo.

Yo te recomiendo como hicieron por hay arriba, que mires lo sources de algun BSD.

Un saludo.

El kernel posee mas de 15 millones de líneas de código según he podido leer en una noticia de principios del año pasado, asi que a día de hoy serán algunas más y solamente del propio kernel en sí.

Saludos.

La primer versión, la 0.01 que fue la lanzada en el año 1991, si no recuerdo mal, tenia 10mil líneas de código.

Saludos.