Si si, he usado una ISO oficial con ese programa, lo he probado en un USB y luego en el DVD con el DVD pude arrancar en fuentes legadas de inicio pero al instalarlo y tal, pasa eso de que no lo reconoce, otra solucion?
¿Estas usando una de las últimas versiones de Kali? Si estás usando un ISO antiguo al parecer no lo soporta (UEFI). Pero es bastante común en las últimas versiones de Kali. No estoy muy seguro que estes creando la USB correctamente. Yo probaría con Rufus, te deja elegir el esquema de particionado (necesitas GPT y no MBR).