¿Tienes instalado el codec xvid 1.1.2?
Si es así debería funcionar al menos esto:
ffmpeg -i archivo.avi -acodec mp3 -vcodec xvid -b 687 nuevoarchivo.avi
Naturalmente tanto el
-acodec (codec de sonido) como el
-b (bitrae) quedan a gusto del usuario...
Aun así el tema del
-vcodec y
xvid no parece muy claro ya que sin ir más lejos en este foro se usa
libxvid, aunque supongo que será sólo un problema de nomenclatura por si acaso te dejo el link:
http://forum.doom9.org/showthread.php?t=133645