La verdad... no termino de comprender tu pregunta.

Si la descarga es en otra carpeta pudes moverte a ella desde el terminal con el consabido cd. Supongo que no tiene mas misterio.

Pero si lo que quieres es mover una carpeta a otro  disco-particion el comando  ln es lo que necesitas. Con el puedes crear enlaces blandos o duros a cualquier sitio independientemente de donde esté montado.

Busca por ahí que hay bastante información.

ln es de esos comandos de ****x que hacen sentir de verdad ante un sistema operativo realmente potente y maduro.