bueno, no soy el mayor experto, de hecho estoy investigando esos temas.

Pero vale, en teoria necesitas esto:

1) Un segmento de red para todos los equipos, y que tengan permisos de acceso al servidor virtual de aplicación, ya sabes, que todos tengan direcciones IP y se puedan comunicar entre si y con el servidor, por lo menos

2) Un dominio de red para resolver direcciones IP  a nombres normales, es decir, si tu servidor es ---> http://192.168.1.5/miservidor, pues necesitas un servicio de DNS para resolver las peticiones de tal manera que los equipos clientes puedan acceder al servidor por un nombre de red que se relacione con esa dirección IP ---> http://miservidorpersonal/miservidor, puede usarse www, terminado en .net, .com, .org...

para ello necesitas un servicio DNS, BIND9 es muy bueno y facil de sincronizar y utilizar, pero antes de que te ataques a instalar programas, sigue leyendo...

3) Dices que vas a poner varias páginas, bueno, yo recomiendo usar un buen CMS, para gustos colores, yo prefiero usar Joomla, en especial la espectacular versión 2.5, pero ultimamente la versión 3 ha empezado a coger fuerza para el acceso con dispositivos PAL, tablets...claro que si vas a usar solo equipos de escritorio pues...te lo dejo a tu gusto, wordpress, drupal, mambo, comicms...hay miles, todos son buenos, tienen lo suyo, no te cierres con un solo sistema, eso es de fanboy, simplemente digo que joomla es el que más me gusta.

4) Obviamente necesitas el servidor web, muchos usan lamp, y es muy bueno, sin embargo, para un uso más serio, profesional...ya sabes, que este bien hecho!!, pues es mejor instalar cada recurso por separado, recuerda que LAMP = Linux, Apache, MySQL, PhpMyAdmin. y es sensacional esa combinación, sin embargo, recomiendo instalar cada servicio por separado...nuevamente, espera un momento al final del post. 

5) Puede que necesites hostear archivos, si vas a colocar un repositorio, pues necesitas configurar correctamente los puertos, tanto si usas un servidor de acceso FTP, o HTTP, o incluso puedes usar un tracker para torrent o yo que se...ya depende de ti, tenlo en cuenta.

6) Si buscas colocar un servidor de correo, pues ahi no se mucho del tema, pero si es importante que sea ligero. No ha de ser dificil, simplemente nunca me he puesto a hacerlo, así que no se que aconsejarte.

7) otra cosa, seguridad, un buen administrador siempre tendra su backdoor, y dejame resumirtelo en tres letras: SSH vital!!!!!!!!! creo que es lo más importante

8) como dije antes, la seguridad amigo, para este apartado, debes tener un firewall y un QoS de acero para tener un buen servicio. Iptables es magía pura en materia de firewall, pero puede que su uso sea dificil, hay otras aplicaciones que facilitan mucho su uso, como ufw o incluso entornos con su propio GUI, pero pues, si eres como yo, y te gusta a lo vikingo, pues usa un buen script y lo vas puliendo poco a poco hasta que te quede como te guste. Lo mismo para el QoS, que inclusive el mismo firewall lo puede hacer, pero es más sabia hacerlo por servicios separados, un portal cautivo es tu mejor opción para el QoS.

para este punto dejame recomendarte una cosa: PACIENCIA.

9) Sabiduria, eres el administrador, así que tenlo muy en cuenta, no vayas a los extremos, no regales todo como un mongolico, pero no seas tirano como un !"#%$$", manten un equilibrio.

Bueno lo prometido es deuda, dejame recomendarte una poderosa herramienta linux con el que haras magía, WEBMIN, es fantastica, no esperes una sinopsis o un analisis de lo que puede hacer, porque puede hacer de todo. aprende  a usar webmin y serás un mago, te lo aseguro, yo aún sigo aprendiendo a usarla, y ya he podido hacer buenas cosas, en serio.

en una palabra: WEBMIN