Existe un software que me permita eliminar archivos pasados 2 meses? O es configuración del servidor?

¿Software para que SO? En linux puedes buscar y borrar archivos con find:

find /directorio -mtime +60 -delete

Lo podrías ejecutar todos los días con una entrada sencilla de cron.

0 0 * * * find /directorio -mtime +60 -delete

O si literalmente quieres borrar archivos cada 2 meses:

0 0 1 */2 * rm -rf /directorio/a/borrar

Lease ( 00:00 del 1 de Febrero, Abril, Junio, Agosto, Octubre, Diciembre).

En Windows tienes el Programador de Tareas (Task Scheduler), pero realmente nunca lo he tocado.