¿Qué desventajas tiene/puede tener la utilización de seriales de oro?
No he visto mucho software con lo que llamas "seriales de oro", pero los hay. La principal desventaja podría ser que el software pueda verificar el mismo utilizando internet y modificar su comportamiento en base a ésto.
Ahora, sin conexión, no imagino mayores problemas (asumiendo que el mismo funcione sin conectividad).
Saludos!
PD:
Los cracks pueden contener todo tipo de malware.
Lo has dicho:
pueden. No siempre es así; pero si, puede ocurrir.