Bueno, al final no he entendido bien la pregunta, pero puedes usar el típico (CCleaner) para hacer una limpieza a fondo de archivos que no tienen un "padre", es una herramienta sencilla y muy útil.
Te dejo el link por si quieres echarle un vistazo (la versión de pago es más eficiente):
https://www.piriform.com/ccleaner/download Luego hay otra que he usado una vez cuando tenía la misma duda que tú, mira a ver si te soluciona algo, y al igual que el CCleaner, la version de pago es mejor:
http://www.geekuninstaller.com/Un saludo!
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