Tienes que actuar antes, cuando estás creando el archivo flash. Tu "materia prima" gráficos y sonidos tienen que estar en el formato adecuado sin exagerar resolución y calidad a menos que lo vayas a distribuir en CD.

La calidad de las imagenes las puedes bajar con Photoshop, pasarlas a gif, y, se te veran bien, el sonido ponlo en "mono" casi nadie lo notara
Por otro lado, existen compresores SWF, busca en este foro, ya se ha hablado de ello